Bahan ajar dalam Pembelajaran Jarak Jauh (PJJ) S2 PAI UIN Siber Syekh Nurjati Cirebon dirancang secara terpadu dan berbasis digital untuk mendukung pembelajaran mandiri dan kolaboratif. Komponen bahan ajar meliputi e-book interaktif, modul pembelajaran di platform e-learning, silabus dan Rencana Pembelajaran Semester (RPS), serta media pendukung seperti video pembelajaran, forum diskusi, dan kuis daring. Seluruh bahan ajar disusun sesuai capaian pembelajaran program studi dan dapat diakses fleksibel melalui Learning Management System (LMS) resmi universitas.